Professeur en histoire contemporaine à l’Université de Nice Côte d’Azur et directeur du Centre de la Méditerranée moderne et contemporaine (CMMC. UPR 1193), Jean-Paul Pellegrinetti est également directeur de publication de la revue les Cahiers de la Méditerranées ainsi que de la revue Études Corses. Il est membre du bureau du Comité d’Histoire Parlementaire et Politique (CHPP) et du Collectif de Recherche et de Débat sur 1914-1918 (CRID 14-18). Il coordonne depuis novembre 2021, un programme de recherches financé par l’Agence Nationale de la Recherche (ANR) et intitulé « Europe et fascisme italien : transnationalisme, circulations et réseaux (1922-1943) ». Il avait déjà coordonné, de 2012 à 2016, un autre programme de recherches financé par l’Agence Nationale de la Recherche (ANR) sur le thème : Identités et cultures en Méditerranée. Les élites politiques de la Révolution française à la Ve République.
Il est commissaire de l’exposition avec Sylvain Gregori « Corsica 39-45. Les Corses et la Deuxième Guerre mondiale (1939-1945) », dans le cadre 80ème anniversaire de la libération de la Corse présentée au musée de Bastia du 8 juillet au 23 décembre 2023. Il a été le commissaire de l’exposition « Les Corses et le Second Empire » qui a lieu au musée de Bastia de juin 2019 à décembre 2019 et le commissaire de l’exposition « Les Corses et la Grande Guerre » qui a lieu au musée de la Corse de juin 2014 à mars 2015. En 2021, il a été coauteur et le conseiller historique d’un documentaire historique en deux volets, intitulé « France-Corse, toute une histoire, XVIII-XXI siècles », en deux volets de 52 minutes pour France 3 Corse et La Chaîne Parlementaire.
Jean-Paul Pellegrinetti a publié dans Etudes Corses n° 45, 48 et 75